בשנת 1319 מוזכר בתעודות בנו של היהודי שורצליין מווינה, סוחר מציסטרסדורף. בשנים 1380 – 1415 נזכרים במקום חמישה יהודים ששם משפחתם ציסטרסדורף. אחדים חיו בווינה, ונפגעו בגזרות וינה של 1420 – 1421. בשנת 1509 הוציא הקיסר מקסימיליאן הראשון, בתוקף תפקידו כדוכס אוסטריה, צו המתיר ליהודי הירשל מגראץ, שחי באייזנשטאט, להתיישב בציסטרסדורף.