הקהילה היהודית במקום קיימת מאז 1850, אולם נוסדה רשמית רק ב- 1863, והשתייכו אליה גם יהודי מחוזות הייצינג-אומגבונג, ליליינפלד, סאנקט פולטן ומלק.
ב- 1932 חיו בסאנקט פולטן 1,603 יהודים. לקהילה היהודית היו מוסדות משלה, בית כנסת, בית עלמין ישן (בשימוש 1860 – 1906) ובית עלמין חדש, מוסדות תרבות, אגודות נשים, חברה קדישא, ועוד.
ד"ר מוריץ טינטר, ד"ר אדולף קוריין, שמואל מרקוס, ד"ר אדולף האן, ד"ר יעקב רייז, ד"ר ברנהרד צימלס וד"ר לאופולד ויינסברג כיהנו כרבנים בקהילה עד סוף המאה ה- 19. ד"ר אדולף שכטר, שבימיו נבנה בית הכנסת החדש, היה אישיות חשובה ומשפיעה בקהילה בתקופה שבין שתי מלחמות העולם. הרב האחרון לפני 1938 היה פרופסור ד"ר ארנולד פרנקפורטר.