כ- 2,400 פליטים יהודים שהו אחרי השואה במחנה בינדרמיכן הסמוך ללינץ. רק כעשרים וששה יהודים מבני הקהילה שרדו את השואה, ועד שנת 1947 שבו אליה רק שלושה עשר. מספרם גדל במקצת בהמשך, אך בכל זאת היה זה סופה של הקהילה היהודית העתיקה בלינץ. מבין אלפי היהודים שחיו בה אחרי השואה, היו אחדים ניצולים ממחנה הריכוז וההשמדה מאוטהאוזן, ואחרים, וביניהם שמעון ויזנטל, עקורים ממקומות שונים. היהודים המעטים בני העיר ששבו אחרי השואה הקימו יחד עם הפליטים בסיס לקהילה יהודית חדשה, שנוסדה בשנת 1947/48. בשנת 1967/68 הקים האדריכל פריץ גופיצר בית כנסת חדש, באותו אתר בו נהרס בית הכנסת הקודם (רחוב בית לחם 26). את ציורי הפנים צייר האמן פריץ פרוליך.
בשנת 2001 חיו בלינץ כמאה יהודים. בנוסף לבית כנסת, מחזיקה הקהילה גם בית עלמין, ופעילה במספר תחומים, ובעיקר מורשת תרבות יהודית.
מאוטהאוזן: כעשרים קילומטרים ממזרח לעיר לינץ, בעיירה מאוטהאוזן, שוכן אתר זיכרון למחנה הריכוז וההשמדה מאוטהאוזן ובו תצוגת קבע על המחנה ומחנות בסביבה.
מחנה מאוטהאוזן נבנה על ידי האס.אס. באוגוסט 1938, חמישה חודשים אחרי ה"אנשלוס" (סיפוחה של אוסטריה לגרמניה הנאצית). המחנה עתיד היה להיות מחנה הריכוז מחוץ ל"רייך הישן" ואחד מן המחנות האיומים ביותר שהקימו הנאצים.
מייסודו ועד לשיחרורו על ידי האמריקנים ביום 5 במאי 1945, התענו במחנה כמאתיים אלף אסירים ממדינות אירופה ואחרות, אשר סבלו מתנאי מעצר לא אנושיים ומעינויים מידי אנשי האס.אס. יותר ממחצית האסירים נספו במחנה. תנאי המחייה כללו זוהמה מחרידה, תת תזונה ותמותה גדולה ממחלות ללא טיפול רפואי. האסירים מתו מתשישות כתוצאה מעבודת פרך, ממחלות בשל התנאים ההיגיינים הקשים, מעינויים ומרצח בתאי גזים בידי אנשי אס.אס. המחנה שוחרר ביום 5 במאי 1945 על ידי הדיוויזיה ה- 11 של צבא ארה"ב. אחד האסירים המשוחררים היה שמעון ויזנטל, שפרסם בשנת 1946 ספר ששמו "מחנה ריכוז מאוטהאוזן – תמונות ומלים".
באתר הזיכרון במאוטהאוזן ישנה מחצבה, המסמלת את עבודת הפרך, הניצול וההשמדה, וכן כמה מבנים מקוריים, כמה בתי קברות, וביניהם "הר האפר", מקום מנוחתם האחרונה של קורבנות מכל חלקי אירופה.
אתר הזיכרון של מחנה הריכוז אבנזי: מחנה אבנזי הוקם כמחנה משנה למאוטהאוזן, ביום 18 בנובמבר 1943, על יד הכפר אבנזי באוסטריה עלית. היה זה אחד מכארבעים מחנות סביב מאוטהאוזן, בהם אולצו אסירים לעבוד עבור תעשיית הנשק הנאצית.